实验教学中心实行校、院两级管理，设主任1人，副主任2人。中心主任全面负责中心工作，副主任协助主任做好实验室建设，具体分管实验室管理和实验教学等各项工作。中心设实验秘书一名，负责日常管理。实验室主任负责本实验室的总体管理，设置实验管理人员，具体负责实验准备、实验室安全、卫生、仪器耗材等的日常管理等工作。

中心设有植物学实验室、动物学实验室、生态学实验室、植物生理学实验室、人体及动物生理学实验室、微生物学实验室、生物化学实验室、分子生物学实验室、遗传学实验室、细胞生物学实验室、中学生物教学研究实验室、现代生物学实验中心、虚拟仿真实验教学中心、生物工程实训中心等教学实验室14个，拥有南四湖生物标本馆和动物标本馆2个生物标本馆（库），为实验教学提供了丰富的资源。